Tecnologia AFA da Covaris: Inovação no Processamento de Amostras FFPE para DNA, RNA e Proteínas

A Tecnologia Acústica Focada Adaptativa (AFA) da Covaris representa um avanço revolucionário na preparação de amostras para análises genômicas e proteômicas. Essa tecnologia utiliza ultrassons de alta frequência e precisão para realizar processos mecânicos, como fragmentação de DNA e RNA, extração de proteínas e homogeneização de amostras. Projetada para funcionar em ambientes clínicos e de pesquisa, a AFA se destaca por sua capacidade de processar amostras desafiadoras, como as fixadas em formalina e incluídas em parafina (FFPE), mantendo qualidade e consistência nos resultados.

Os benefícios da AFA na preparação de bibliotecas de DNA e RNA de alta qualidade a partir de amostras FFPE demonstram sua superioridade em relação aos métodos enzimáticos de extração e fragmentação. A tecnologia proporciona fragmentos de maior qualidade e tamanhos de inserção consistentes, mesmo ao trabalhar com material altamente degradado ou em quantidades limitadas. A integração dessa tecnologia em fluxos de trabalho automatizados melhora significativamente o desempenho e reduz os erros no sequenciamento. Além disso, a AFA permite análises proteômicas e epigenéticas abrangentes em amostras FFPE, sendo um grande avanço no estudo de doenças como sarcomas.

A tecnologia AFA utiliza ultrassons para cortar material genético de forma controlada e reprodutível. Isso resulta em bibliotecas de maior qualidade em comparação aos métodos enzimáticos, especialmente para amostras FFPE. A AFA melhora a qualidade da análise de várias maneiras:

Fragmentos de alta qualidade: As amostras processadas com o sistema AFA atingem métricas DV200 superiores a 20%, indicando maior integridade do DNA.

Extração de RNA longo: Facilita a obtenção de fragmentos de RNA maiores em amostras arquivadas, sem perda significativa de qualidade ou quantidade.

Versatilidade: Adapta-se a diferentes fontes de DNA e materiais de extração sem necessidade de ajustes no protocolo.

Integração automatizada: Funciona com plataformas automatizadas, como o R230, garantindo rastreabilidade das amostras durante todo o processo, essencial em ambientes clínicos.

A AFA também se destaca na extração de proteínas de amostras FFPE. A combinação de ultrassons com tecnologias como S-trap é altamente eficiente nesse contexto. Além disso, a sonicação permite a homogeneização direta de amostras parafinadas em tampões SDS, economizando tempo e etapas adicionais no processamento proteico.

A obtenção de fragmentos consistentes e de elevada qualidade acaba por se refletir na fiabilidade dos dados nas várias aplicações clínicas e de investigação desta tecnologia.

A precisão na fragmentação e a consistência dos resultados tornam a AFA ideal para a preparação de bibliotecas NGS, especialmente em tecnologias de leitura longa. Isso reduz a taxa de discordância, um fator crucial na identificação de variantes genéticas, mesmo em amostras limitadas como aquelas com apenas 10 ng de DNA.

A tecnologia AFA da Covaris combina alto desempenho em amostras degradadas com fragmentação controlada e consistente. Suas soluções recentes em escalabilidade e transferência de amostras fazem dela uma ferramenta indispensável para a obtenção de resultados confiáveis em amostras FFPE, tanto em ambientes clínicos quanto de pesquisa. Essa tecnologia é uma solução precisa e confiável, oferecendo resultados de alta qualidade para análises genômicas, transcriptômicas e proteômicas em amostras desafiadoras.